工程实验室按照相对独立的模式组建，实行管理委员会领导下的主任负责制。成立以国内外知名专家学者组成的技术委员会，技术委员会以会议或网络的形式开展工作。设立5个技术开发平台，平台主任对工程实验室主任负责，接受工程实验室主任的领导；设立20个PI及其团队，PI对平台主任负责，接受平台主任领导；研究团队成员对PI负责，接受PI领导。